খুলনা বিশ্ববিদ্যালয়ে শিক্ষার্থীদের জন্য থাকা ব্যবস্থায় তীব্র সংকট দেখা দিয়েছে। বিশ্ববিদ্যালয়ে বর্তমানে ৯,১৪৭ জন শিক্ষার্থী অধ্যয়নরত থাকলেও, আবাসনের জন্য সিট মাত্র ২,৯১৪টি। এর ফলে শিক্ষার্থীদের প্রায় ৬৩% ছাত্রী এবং ৭৩% ছাত্র ক্যাম্পাসের বাইরে বসবাস করতে বাধ্য হচ্ছেন।
ক্যাম্পাসের বাইরে থাকা শিক্ষার্থীরা নানা সমস্যার মুখোমুখি হচ্ছেন। তাদের অভিযোগ, বাইরে থাকার কারণে খাবার, পানি, যাতায়াত এবং নিরাপত্তার বিষয়গুলোতে সমস্যা তৈরি হচ্ছে। বিশেষ করে নিরাপত্তা সংক্রান্ত উদ্বেগ এবং অতিরিক্ত ভাড়া পরিবারের উপর চাপ তৈরি করছে। একাধিক শিক্ষার্থী জানিয়েছেন, হলে থাকা শিক্ষার্থীরা নিরাপদ বোধ করেন এবং পড়াশোনায় মনোযোগ বজায় থাকে, কিন্তু বাইরে থাকলে শিক্ষার মানও প্রভাবিত হয়।
অভ্যন্তরীণ তথ্য অনুযায়ী, বিশ্ববিদ্যালয়ের আবাসন সংকট সমাধানের জন্য প্রশাসন ইতোমধ্যেই তিনটি নতুন ১০ তলা হল নির্মাণের প্রস্তাব মন্ত্রণালয়ে পাঠিয়েছে। এর মধ্যে খান জাহান আলী ও অপরাজিতা হলে এক্সটেনশন এবং একটি নতুন হল অন্তর্ভুক্ত, যা প্রায় তিন হাজার শিক্ষার্থীর আবাসন নিশ্চিত করবে। তবে বর্তমান পরিস্থিতিতে শিক্ষার্থীরা মানসিক চাপ ও নিরাপত্তাহীনতার মধ্যে পড়ছেন।
বিশ্ববিদ্যালয়ে শিক্ষার্থীদের সংখ্যা বৃদ্ধি পেয়েছে, কিন্তু হলে কোনো উল্লেখযোগ্য বৃদ্ধি হয়নি। ২৯টি ডিসিপ্লিনের মধ্যে ১৩টি ২০০৯ সালের পরে প্রতিষ্ঠিত হলেও, নতুন হল তৈরি হয়নি। শিক্ষার্থীরা বিভিন্ন সময় দাবি জানিয়েছে নিরাপদ, আধুনিক এবং পর্যাপ্ত আবাসনের জন্য।